De acuerdo con un reporte del Centro de Estudios de las Finanzas Públicas la Universidad Autónoma de Baja California tiene un presupuesto aprobado para 2025 por 6 mil 135.4 millones de pesos. En este caso, destaca que los recursos federales y estatales, son iguales con 2 mil 242.3 millones de pesos, lo que representa el 36.5 por ciento, en cada caso. Asimismo, los ingresos propios alcanzan 1 mil 133.1 millones de pesos, representando el 18.5 por ciento del total, lo cual refleja una alta capacidad de generación de ingresos respecto a otras instituciones. Cabe señalar que se incluyen también excedentes de ejercicios fiscales anteriores por 517.7 millones de pesos, los cuales representan el 8.4 por ciento del total, señala el Centro.