Baja California ocupa el quinto lugar en el país de personas desaparecidas sin ser localizadas. Son bajacalifornianos ocho de cada 100 personas que, víctimas de desaparición forzada en México en 2026, de los cuales sigue sin conocerse su paradero, de acuerdo con el Registro Nacional de Personas Desaparecidas y no Localizadas de la Comisión Nacional de Búsqueda. Son hombres y mujeres a los que desaparecieron de enero a junio de 2026 y cuentan con reportes y carpetas de investigación en la fiscalía estatal. El reporte de aún no localizados del Registro Nacional de la Comisión de Búsqueda señala que el primer lugar lo ocupa la Ciudad de México (541), seguido de Michoacán (379), Sinaloa (351), Nuevo León (341) y Baja California (340), esto en 2026.

TIJUANA Y MEXICALI LIDERAN Por otra parte, en un reporte difundido por el Instituto Mexicano de Derechos Humanos y Democracia (IMDHD) con apoyo financiero de la Unión Europea señala que del 2022 a mayo de 2026 en Baja California hay cinco mil 88 personas desparecidas, con una calificación "Nivel superior de gravedad". Al 16 de mayo de 2026, 810 personas tenían menos de 18 años cuando fueron desaparecidas, siendo la mayoría niñas, exactamente el 51.39 por ciento. Los casos de desaparición en Baja California comienzan a ser registrados a partir del 2006, siendo el 2025 el año con la mayor concentración de casos, con 1,011 personas que continúan desaparecidas. El 2024 es el segundo año con más desapariciones con 804 casos. A partir del 2018 hubo un descenso en el número de casos, sin embargo para el 2020 los casos continuaron aumentando y no se han detenido. El 70.28% de los casos de personas desaparecidas y no localizadas está en el rango de edad entre los 15 y 44 años. Hay 166 casos sin edad de referencia. Tijuana concentra la mayor cantidad de casos de personas desaparecidas, para mayo de 2026, continuó como el municipio con más casos, pasando de 2,500 a 3,245 casos; es decir, en 1 año aumentaron 745 casos. Le sigue Mexicali con 922. En los demás municipios: Ensenada (365); Rosarito (194) y Tecate con 160.